Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms