Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms