Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms