Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms