Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms