Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mmp25Q3U435 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp25Q3U435 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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