Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hvcn1Q3U2S8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms