Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud5Q3U2S4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms