Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms