Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms