Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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