Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms