Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms