Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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