Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTJ4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms