Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh5Q3TSG4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh5Q3TSG4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms