Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms