Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms