Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms