Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms