Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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