Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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