Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm1Q2TV84 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms