Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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