Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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