Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col19a1Q0VF58 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms