Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samd12Q0VE29 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms