Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms