Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms