Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms