Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnnm1Q0GA42 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnnm1Q0GA42 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms