Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms