Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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