Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q08AU9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms