Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms