Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms