Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cab39Q06138 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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