Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms