Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms