Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Top1Q04750 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms