Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms