Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms