Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms