Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col1a2Q01149 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms