Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms