Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms