Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms