Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms