Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms