Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn1bP97952 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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